你小程序的登录逻辑是什么样的就还是不影响的，这只是换个方式打开了小程序

公众号菜单跳转小程序，就是普通的打开了小程序而已，不过可以自定义路径和携带参数罢了，该怎么登录还是怎么登录

登录与不登录都是相对于当前微信号而言。