在查询完毕后再来一次match将连接后的数据 _.neq([])

.match({
  list: _.neq([])
})

db.collection('t_lease').aggregate()
  .match({
    tenantId: wxContext.OPENID,
    delFlag: false,
  })
  .lookup({
    from: 't_house',
    let: {
      houseId: '$houseId'
    },
    pipeline: $.pipeline()
        .match(_.expr($.and([
            $.eq(['$_id', '$$houseId']),
            $.eq(['$delFlag', false]),
        ])))
        .done(),
    as: 'houses',
  })
  .match({
    houses: _.neq([])
  })
  .end()

lookup