免费。不用扫码支付300元。

行政机关注册微信小程序的认证费用并非完全免费。根据微信公众平台的规定：

1. 政府及特定组织类型（如政府机构、基金会、国外政府驻华代表处等）可享受免费认证政策，无需支付300元审核服务费。
2. 其他非政府主体（如企业、个体工商户等）需支付300元/次的认证费用，且该费用为一次性支付，无需年审。

注意事项：

• 若行政机关通过非政府主体类型（如企业）注册小程序，则需按普通主体标准支付认证费用13。
• 认证前需确保材料真实有效，虚假信息将导致认证失败。

建议根据实际注册主体类型确认是否符合免费条件，并提前准备相关资质文件

具体是否收费，是根据提供的认证材料和主体类型是否符合。