开启服务器配置后，开发者可以在自己服务器上接收消息/事件推送（比如用户发送的消息、点击菜单的事件等等），开启后公众号后台的【自定义菜单】和【自动回复】就会失效并停用。

如果需要开启服务器配置，又要设置【自定义菜单】和【自动回复】，可以让开发者参考文档使用相关接口实现；或者是将公众号授权给第三方平台，在第三方平台那边设置。

自定义菜单文档：https://developers.weixin.qq.com/doc/offiaccount/Custom_Menus/Creating_Custom-Defined_Menu.html

被动回复用户消息文档：https://developers.weixin.qq.com/doc/offiaccount/Message_Management/Passive_user_reply_message.html

公众号api接口实现自动回复：https://developers.weixin.qq.com/doc/offiaccount/Message_Management/Passive_user_reply_message.html

api接口创建自定义菜单：https://developers.weixin.qq.com/doc/offiaccount/Custom_Menus/Creating_Custom-Defined_Menu.html

不能兼容的，必须二选一。

不过，开启服务器配置后，可以通过接口创建菜单和关键字回复。