有可能是以下原因：

1. 聊天记录未同步：如果你最近刚刚升级到新版微信，可能需要等待一段时间，让系统完成聊天记录的同步。在同步完成之前，你可能无法通过搜索功能找到之前与企业用户的聊天记录。请耐心等待，并确保你的网络连接正常。
2. 聊天记录被隐藏或删除：如果你曾经手动隐藏或删除了与企业用户的聊天记录，那么这些记录将无法通过搜索功能找到。你可以检查一下是否有意无意地隐藏或删除了相关的聊天记录。