1、适用行业不同：服务商分账适用的行业比较广泛，电商收付通仅适用于电商行业或电商SaaS；

2、涵盖的功能不同：电商收付通相当于服务商分账在电商行业的升级版，功能多了小微商户进件、合单支付、补差、可选手续费承担主体（电商平台/二级商家）、资金冻结最长 180 天（服务商分账是30天）；

3、要求不同：电商收付通的资质要求更高，要有ICP许可证或EDI许可证（这里的许可证不是icp备案截图）；

多商户电商平台如果要解决二清合规问题，就要对接电商收付通。

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境内服务分账，对申请资质没有特殊要求，电商收付通依赖于有主体一致的ICP许可证；境内服务分账和电商收付通都依赖微信服务商商户号，单独普通商户实现不了分账功能；境内服务分账只限于分账功能，电商收付通支持合并订单等一系列平台电商场景服务；电商收付通的二级商入驻支持API信息提交开通，并且与普通商户号隔离，境内服务分账二级商户则利用现有商户id，个人openid可进行直接分账

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https://pay.weixin.qq.com/wiki/doc/apiv3/wxpay/ecommerce/guide/chapter1_1.shtml

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