同一个微信小程序，存在两种接入微信支付的方式，一部分商户是直连微信接口费率是0.6% ，另一部分商户接入第三方支付机构支付，第三方支付机构给到某一商户的费率是0.2% ，但是上周出现了第三方支付商户，支付功能被关停的问题（因是第三方合作商户，无法获取商户助手内通知的限制支付原因），但是直连微信接口千六手续费的商户能正常支付；
第三方机构接口返回错误："此商家涉嫌违规，收款功能已被限制，暂无法支付。商家可以登录微信商户平台/微信支付商家助手小程序查看原因和解决方案。
想要确认：微信支付是否允许同一小程序内，不同商户走不同支付对接流程且费率不同？？？什么情况下会存在微信支付认定为违规然后关停支付？？？？
问题描述的理解有误。微信支付通道分直连和间连，间连通道又分线上和线下，线上的渠道成本是0.6%，线下的渠道成本是0.2%。
所谓的线上线下是指业务场景，比如需要用户扫码打开小程序的就是典型的线下场景；如果是纯线上场景（不需要用户扫码，且用户与商家异地）套用线下低费率通道，这种就很容易遇到系统风控。
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微信支付是否允许同一小程序内，不同商户走不同支付对接流程且费率不同
回复：没有问题，一个小程序可以对接多个商户号，费率和流程不同是可以的。
因是第三方合作商户，无法获取商户助手内通知的限制支付原因。
回复：法人代表知道商户号，完全可以自己登录支付平台，关联商户号就行。如果不行就问服务商什么原因，根据不同的原因处理好一般就能用了。