我们公司因为历史原因，原主体无法完成备案，需要变更主体。现在申请函和两边公章都已经盖好了，涉及到公证问题。两家公司都是同一个法定代表人，其中一个是“xxx（北京）有限公司”，另一个是“xxx（上海）有限公司”。二者不是分公司和总公司关系，也不是子公司和母公司关系，但是是同一名字不同地区的两家公司。想请问这种情况能不能不进行公证？目前法定代表人由于职级太高完全不可能出面公证，特此来询问一下。