管理员扫码登录公众号后台也可以自主注销。

要是管理员微信也不在手上，只能是通过主体验证，找回账号：https://mp.weixin.qq.com/acct/findacct?action=scan，重置登录邮箱、密码、管理员微信，用新的管理员微信扫码登录公众号后台自主注销。