在服务商的子商户中关联小程序就可以了,前提是和子商户是同一主体

小程序支付与公众号支付是分开的，支持服务商模式，请参考文档：https://pay.weixin.qq.com/wiki/doc/api/wxa/wxa_sl_api.php?chapter=7_3&index=1

在小程序中可以关联服务商，但是如果在小程序上已经申请了，就无法挽回了，现在小程序没有返回机制。

所以我就申请了两个服务商。

他们两个是独立的。