您好，可以同时运行在微信与企业微信上，小程序如果需要同时运行在微信和企业微信端，需要针对企业微信的环境适配部分不兼容的能力，针对微信环境适配企业微信专有的部分接口能力。https://work.weixin.qq.com/api/doc/90000/90136/92455

最近也在关注这个问题。运行在企业微信环境已经可以取出userid了。运行在微信环境还在研究中。

https://developers.weixin.qq.com/miniprogram/dev/api-backend/open-api/login/auth.code2Session.html