在使用wx.openDocument方法打开下载后的PDF文件时，缺少右上角的三个点按钮可能是由于以下原因之一：

小程序版本限制：某些早期版本的微信小程序可能不支持显示右上角的三个点按钮。确保你的微信小程序版本是最新的，以获取最新的功能和界面。

PDF阅读器限制：右上角的三个点按钮通常是PDF阅读器提供的功能，而不是小程序本身。不同的PDF阅读器应用程序可能在功能和界面上有所不同。你所使用的PDF阅读器可能没有提供该按钮。

小程序自定义界面：开发者有权对小程序界面进行自定义，包括隐藏或更改原生界面元素。因此，可能存在某些小程序在打开PDF文件时隐藏了右上角的三个点按钮。这是由开发者设计决策所致，无法直接更改。

如果确实需要访问右上角的三个点按钮提供的功能（如分享、保存等），你可以尝试以下方法：

检查小程序版本：确保你的微信小程序版本是最新的。更新到最新版本可能会解决某些问题，并提供新的功能和界面。

使用其他PDF阅读器应用程序：尝试使用其他支持PDF阅读的应用程序打开下载后的PDF文件。这些应用程序通常提供更丰富的功能和界面选项。

与开发者联系：如果你认为缺少右上角的三个点按钮是错误或不符合你的预期，你可以与小程序的开发者或支持团队联系，提出你的问题并寻求解决方案。他们可能能够提供更具体的帮助和指导。

总之，缺少右上角的三个点按钮可能是由于小程序版本、PDF阅读器或开发者自定义界面的原因。尝试更新版本、使用其他应用程序或与开发者联系可能会有助于解决问题。

新开页面打开文档。微信客户端 7.0.12 版本前默认显示右上角菜单按钮，之后的版本默认不显示，需主动传入 showMenu。

https://developers.weixin.qq.com/miniprogram/dev/api/file/wx.openDocument.html