两家公司之间有合作协议，A公司是宁波一家公证处，属于非盈利性事业单位，B公司是上海集赢智能科技有限责任公司，B公司是A公司的软件开发商以及平台运营方，当前想要新开发一个小程序，由A公司公证处提供在线的公证服务，向用户通过微信支付收取一定的公证费用，A公证处是有合法合规的公证资质的，请问如果要发布这个小程序，微信收款是以公证服务费为由但是由B公司科技公司主体来收取，请问应该如何进行操作？