根据已有知识，为你的问题提炼出以下关键的解决要点：

小程序主体变更确实可能影响商圈积分，因为商圈积分通常与商户号绑定。

为了解决这个问题，建议您按照以下步骤操作：

首先，在微信支付商户平台提交主体变更申请；

其次，等待审核通过后，重新绑定新的商户号；

最后，根据商圈积分系统的提示，更新积分信息。

这样，您的商圈积分应该能够恢复正常。