你是否授权了第三方管理自动回复呢？检查一下，重新设置或解除授权。

若出现公众号后台没有设置的自动回复，你可以到[设置与开发 -> 公众号设置 -> 授权管理]里面看下哪个第三方平台有【消息管理】权限，到第三方平台那边问下，或者如果不需要就直接解除授权，再看看还会不会有这条回复。