【在注册小程序账号的时候，如果主体登记为个人，后续还可以修改成企业吗？】可以。

【另外，如果选择企业登记，公账审核和微信审核有什么区别，如果选择公账审核后续会有什么限制呢？】没区别。因为现在规则微信认证是必须的，微信认证步骤中有个验证主体操作也是对公打款；

对公打款是验证主体操作，打款成功后会自动退回原账号，对后续没限制。